Por outro lado, o uso inadequado ou por muito tempo dos corticoides pode acarretar uma série de problemas. Entre os mais comuns, destaca-se a imunossupressão, que predispõe os animais a infecções oportunistas. Do mesmo modo, o desenvolvimento da síndrome de Cushing iatrogênica é uma grande preocupação e esta doença se caracteriza por sintomas como aumento da sede, do apetite e da micção, além da fraqueza muscular e do aumento do volume da barriga do paciente. Vale ressaltar que o uso prolongado também pode levar à osteoporose e à dificuldade na cicatrização de feridas, fatores que comprometem a recuperação dos pacientes.

Além disso, a parada súbita na administração do medicamento (sem desmame adequado) pode resultar em insuficiência adrenal, um problema sério que pode levar à morte do animal. Portanto, é crucial reduzir a dosagem gradualmente sob supervisão veterinária para evitar essa complicação. Não menos importante, os corticoides podem causar efeitos colaterais gastrointestinais, como úlceras e gastrites, especialmente quando administrados sem proteção gástrica ou em combinação com anti-inflamatórios não esteroidais.